目前在临床上，卵巢巧克力囊肿不属于恶性肿瘤，它属于卵巢肿瘤的一种良性的病变，但是卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种。它是具有生长功能的子宫内膜移位组织移位到卵巢，从而引起卵巢囊肿的发生，这种情况往往会出现周期性的腹部疼痛，而且会出现进行性加重的痛经，严重者会影响女性的生育功能，造成女性怀孕困难，甚至出现继发性的不孕症。当卵巢巧克力囊肿太大时，则有囊肿破裂的可能，甚至是出现蒂扭转。卵巢巧克力囊肿一旦破裂后，有可能导致整个腹腔出现子宫内膜种植的异位病灶，从而引起腹部疼痛的现象。

患有巧克力囊肿的患者在月经期，一部分人会产生腹部疼痛的现象，而且疼痛的程度有轻有重，严重者甚至影响女性的工作、生活，甚至伴有恶心、呕吐。而巧克力囊肿是由于移位的子宫内膜侵入了卵巢而引起的一种病症，这种情况大多数情况还是建议通过保守用药来进行治疗。如果囊肿较大，而且影响患者生育，则需要进行手术的方式来进行治疗；如果反复发生的巧克力囊肿，也可以通过抽超声下穿刺介入治疗女性在平时日常生活中应该注意规律作息，避免压力过大，避免熬夜。

巧克力囊肿治疗方法有手术治疗、药物治疗、放置宫内节育器等，主要是根据患者的年龄、生育要求的综合评估。1、对无生育要求，年龄45岁左右、症状重、病灶累及重要脏器或多种治疗无效者，建议行全子宫双附件切除术根治。双侧卵巢切除后，没有激素的支持，异位的病灶会萎缩退化消失。2、对于年轻要求生育的患者和不孕症患者经全面检查排除其不孕因素，首先应该尽早在腹腔镜下明确诊断，分离盆腔粘连，去除肉眼可见的病灶，恢复正常的解剖结构。保留子宫和卵巢。手术可以明确诊断，排除恶性肿瘤，缓解疼痛，改善生活质量，能显着提高轻度内异症的自然妊娠率。然后药物抑制内异症的残余病灶，改善盆腔的免疫环境，抑制雌激素水平。最后，建议中重度患者尽早积极采用辅助生殖技术助孕。不应长期期待或药物治疗。3、对无生育要求较年轻的患者可以选择腹腔镜手术去除病灶，保留卵巢和子宫，宫内放置曼月乐的方法，曼月乐是一种含有孕激素的宫内节育器，即可以避孕，又可以缓解痛经和月经过多的症状，预防内异症复发。如果没有口服避孕药禁忌症的患者也可以长期服用避孕药。

卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，卵巢巧克力囊肿病变可只累及一侧卵巢，但约有50%以上的患者会累及双侧卵巢；随着病情的发展，患者可出现痛经、持续性下腹疼痛、月经失调、不孕和性交痛等病症。目前主要有西药治疗、手术治疗和中医治疗技术等，药物治疗主要目的是抑制雌激素合成，使异位种植的子宫内膜萎缩，或切断下丘脑-垂体-卵巢轴的刺激和出血周期，但对于较大的巧克力囊肿，不宜采用性激素治疗，腹腔镜是目前手术治疗内异症的主要手段。

巧克力囊肿会影响月经吗？一般来讲，卵巢的巧克力囊肿不会影响月经，因为月经是由卵巢的雌孕激素，是由整个人体内的有一个生殖内分泌轴来决定月经的。卵巢它主要是分泌雌孕激素，雌孕激素作用在子宫内膜，使子宫内膜出现周期性的变化，出现周期性的脱落，那么在脱落的过程中会有出血，所以我们叫它月经。一般来讲卵巢的巧克力囊肿不会影响卵巢分泌雌孕激素，所以它对月经的影响几乎没有。如果说患者的月经不正常，到医院来检查，可能会是因为其他的原因造成的月经的不调，而并非是因为卵巢的巧克力囊肿。当卵巢巧克力囊肿长得过大，或者出现破裂的时候，在这种情况下，有可能使患者暂时的出现月经的不正常。比如说点滴出血，或者是时间过长，也可能会出现闭经。但总的来讲，卵巢的巧克力囊肿不会影响正常的月经。