目前临床上认为巧克力囊肿的形成原因，是具有生长功能的子宫内膜异位到了卵巢位置，从而形成卵巢巧克力囊肿。它属于子宫内膜异位症的一种，病因主要是子宫内膜种植而形成的，所以巧克力囊肿的形成原因是因与饮食没有关系的。在正常情况下子宫内膜就在子宫腔内，随着卵巢分泌激素的影响而发生周期性的脱落，而子宫内膜跑到了卵巢的位置，就会形成卵巢巧克力囊肿，这种情况下如果囊肿较小是不用需要手术的。如果囊肿大于五厘米而且临床的不适的症状比较明显，则需要进行手术治疗。在饮食上应该避免食用辛辣、寒凉、生冷等刺激性的食物，这些食物不利于机体的恢复。

卵巢巧克力囊肿也叫做子宫内膜异位囊肿，这是具有生长功能的子宫内膜腺体或者间质移位到了卵巢而形成的囊肿。因其其内的囊液为巧克力色样的液体，所以我们称之为卵巢巧克力囊肿。主要的临床表现为进行性加重的痛经，出现卵巢巧克力囊肿的患者，在与平时日常生活中的饮食物中，需要注意一些辛辣的食物，比如说葱、姜、蒜、花椒、胡椒、韭菜，这些食物尽量避免食用。而腌制品，比如说酸菜、泡菜以及一些油炸食品、膨化食品、碳酸饮料和高脂肪的食品、高盐的食品，尽量要避免食用。女性可以在平时日常生活中，多吃一些富含有新鲜蔬菜和水果，以及含有优质蛋白质的食物。

在一般情况下巧克力囊肿的患者是可以怀孕的，但是如果巧克力囊肿不大，没有影响到卵巢的正常功能，这个卵巢是可以正常排卵的。在这种情况下女性的怀孕一般是不会受到影响，所以巧克力囊肿的患者是可以怀孕的。但是如果巧克力囊肿比较大，而且影响了卵巢的功能，从而引起卵巢不能正常排卵，而且巧克力囊肿引起的盆腔粘连、输卵管不通、输卵管梗阻，这种情况下是容易引起女性不孕的发生。所以巧克力囊肿的女性能不能怀孕，需要结合患者的具体情况来决定的。建议有巧克力囊肿的女性，应该尽早的去医院进行治疗，必要时可以进行手术把巧克力囊肿切除掉然后再进行怀孕。

巧克力囊肿的常见症状为疼痛、盆腔包块和不孕。疼痛主要表现为痛经，月经来潮前或者其前后下腹部为主的疼痛。疼痛可能与月经周期有关系，也可能与月经周期无关，时轻时重。此外，还可引起深部性交痛。巧克力囊肿破裂会引起急性下腹痛，这种情况需要急诊手术治疗。巧克力囊肿是引起不孕的常见原因，在不孕患者中，50%的病因与巧克力囊肿有关系。子宫内膜异位症引起不孕的原因很多，可能是卵巢功能本身的问题，或者腹腔微环境的问题。巧克力囊肿形成病灶以后，由于每月一次的反复病灶出血，巧克力囊肿会逐渐长大，长大的过程中，如果张力过大，囊肿就会破裂。如果内容物较多或者较大，就会导致急性的剧烈腹痛；如果囊肿很小或者破口很小，破口可以自然闭合，但流出去的囊内液会导致囊肿与周围器官粘连。

卵巢巧克力囊肿又称为卵巢子宫内膜异位囊肿，主要症状是下腹痛、痛经、不孕及性交不适。不孕率高达40%。所以说怀孕几率大概是60%。引起不孕的原因复杂，如盆腔微环境改变影响精卵结合及运送，免疫功能异常导致抗子宫内膜抗体增加而破坏子宫内膜正常代谢及生理功能、卵巢功能异常导致排卵障碍和黄体形成不良等。此外，未破裂卵泡黄素化综合征在内异症患者中具有较高的发病率。中、重度粘连者可因卵巢、输卵管周围粘连而影响受精卵运输。如果巧克力囊肿直径大于4cm建议手术治疗。腹腔镜手术是首先的治疗方式。年轻、轻中度者，术后可期待自然妊娠6个月，对于年龄大于35岁，不孕年限超高3年，尤其是原发性不孕者，重度内异症、盆腔粘连、病灶切除不彻底者，输卵管不通者，应积极辅助生殖技术助孕。