巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，子宫内膜异位症的典型症状是下腹部疼痛。痛经疼痛是内异症的主要症状，它的典型症状为继发性痛经进行性的加重，疼痛一般多位于下腹部、腰骶部以及盆腔正中，有时可以呈现放射至会阴、肛门以及大腿，常于月经来潮时出现并且持续整个月经期，疼痛的严重程度与病灶大小不一定成比例，年龄严重的卵巢巧克力内膜异位症人患者，甚至可以引起无法忍受的疼痛，而且内异症的患者不孕正的比例是比较高的。它引起不孕症的原因比较复杂，比如盆腔微循环的改变影响精子、卵子相结合，性交不适也是比较常常出现的症状。

卵巢巧克力囊肿是没有潜伏期的，卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种特殊类型，它是具有生长功能的子宫内膜腺体或者间质侵入卵巢组织所引起的卵巢巧克力囊肿，这种囊肿在早期时，由于囊肿位于盆腔的深部，所以症状并不是很明显。当发现时往往超声检查时会被发现，此时已出现病灶，最主要的临床表现为小腹部疼痛，有肿块，白带颜色黄，异味，月经失常，性交痛，严重者会影响卵巢的内分泌功能，从而导致月经不调。如果移位的内膜组织侵入到了肠胃，甚至会引起腹泻，胃肠疼痛。

巧克力囊肿是属于最常见的子宫内膜异位症，不但会引起进行性加重的痛经表现，还可能因为囊肿过大，而出现卵巢囊肿的破裂或者扭转，甚至会影响女性的生育功能，导致女性不能正常怀孕。所以对于检查发现有卵巢巧克力囊肿的女性，一般当巧克力囊肿超过5厘米以上，就需要考虑行手术进行治疗，在囊肿没有破裂的情况下，可以行腹腔镜微创手术，因为这类手术切口比较小，术后恢复又比较快。但对于已经出现囊肿破裂或者扭转的女性，就可能需要行开腹手术进行切除。术后还需要肌注亮丙瑞林，或者曲谱瑞林来继续治疗，其目的就是为了预防巧克力囊肿的再次复发。因为在手术的过程中，可能没办法将异位的子宫内膜组织完全清除干净，所以最好进行继续药物治疗。

巧克力囊肿不是必须手术治疗，巧克力囊肿是子宫内膜异位症的常见类型，跑出子宫腔的异位内膜在卵巢生长，形成囊肿。既然是内膜，即使不在子宫腔，它也会受到月经周期雌孕激素波动的影响，来一次月经，就长一点。然后脱落的内膜又不能像月经一样排出，只能呆在囊肿里，越积越多。这些陈旧性的出血，样子类似巧克力液，所以俗称巧克力囊肿，学名是“卵巢子宫内膜异位囊肿”。育龄期患者常合并不孕症，在不孕或有盆腔疼痛症状的妇女中发现率为20%-68%，临床上首先需对患者进行全面的不孕检查和生育评估，再结合病情的评分和生育指数，来给予生育指导。巧克力囊肿的治疗较为困难。总体原则是去除病灶、减轻疼痛、改善和促进生育、减少和避免复发。一般认为，对首次发现的巧克力囊肿直径≧4cm，可考虑手术治疗，首选腹腔镜下囊肿剔除术。但手术后极易复发，复发率为6%-67%。术后2年复发率为百分之二十一点五，术后5年高达4%-50%。

巧克力囊肿会引起不孕。卵巢巧克力囊肿又称为卵巢子宫内膜异位囊肿，主要症状是下腹痛、痛经、不孕及性交不适。巧克力囊肿不孕率高达40%。引起不孕的原因主要有：盆腔微环境改变影响精卵结合及运送，免疫功能异常导致抗子宫内膜抗体增加而破坏子宫内膜正常代谢及生理功能、卵巢功能异常导致排卵障碍和黄体形成不良等。此外，未破裂卵泡黄素化综合征在巧克力囊肿中具有较高的发病率。对于有生育要求的巧克力囊肿女性，虽然有时候囊肿不大小于4cm，在积极备孕，且排除排卵异常及丈夫精液的问题，半年左右还不成功怀孕，可以考虑腹腔镜检查，在剥除囊肿的同时还可以进行输卵管通液，分解周围粘连。因为这种囊肿不会随着时间而自行好转，目前也没有很好的药物可以根治，如果不手术，卵巢功能的破坏和盆腔粘连越来越严重，导致手术效果不好，术后复发率极高，且怀孕几率大大降低。首选腹腔镜手术，术后可以增加怀孕的几率。