胃窦糜需要通过进行胃镜检查后，根据病情对症治疗。若胃窦糜烂由炎症导致，甚至部分患者无明显症状，一般无需特殊治疗，无需过度担心；
若患者出现明显症状，如较明确的炎症反应，一般建议患者进行幽门螺杆菌检测；若合并幽门螺杆菌感染，应根据患者药物过敏史等情况，进行杀菌治疗，清除幽门螺杆菌，常用治疗方法为四联法；
患者可进行内镜下检查，以排除胃癌早期病变；
可以使用奥美拉唑、加丽珠得乐、加阿莫西林。三联疗法，抑制胃酸分泌，保护胃部黏膜，消炎抗病毒，多管齐下，可以有效缓解症状。平时注意多吃流食、半流食、忌食辛辣、刺激、油腻、生冷食物，温热饮食、清淡饮食、戒烟戒酒。
胃窦糜烂指的是胃窦部胃粘膜层糜烂，如果超过内膜基层导致溃疡。症状类似于消化不良，如胃胀、胃痛、反酸、嗳气、腹泻、便秘、恶心、呕吐等。