肾囊肿术后有一定的复发率，但是很小的，其复发率与治疗措施和方法有关，其中囊肿穿刺抽吸，注射无水酒精，复发率高，但是在切开减压术可切除部分突出于肾实质表面的囊壁，复发率低，此外，腹腔镜下肾囊肿切除减压可通过在囊肿壁上放置钛夹来降低复发率。