卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种特殊类型，它是具有生长功能的子宫内膜腺体或者间质侵入卵巢所引起的卵巢巧克力囊肿，这种疾病会容易引起盆腔粘连，必要时需要进行手术来松解盆腔粘连的目的，从而达到治疗疾病的目的。而女性的大多数的盆腔粘连是因为炎症感染所引起的，所以在治疗期间可以联合的使用抗生素来进行消炎治疗，直到病情完全恢复。对于卵巢巧克力囊肿的患者，不建议吃辛辣、寒凉刺激性的食物，否则会对疾病产生影响，而对于巧克力囊肿大于五厘米的，则需要进行手术切除。在手术切除这段时间，饮食方面也需要多加注意。

巧克力囊肿手术后是否影响生育，需要了解清楚手术的过程，如果患者没有生育过，临床医生一般会考虑患者有生育需求，尽量保留患者的生育能力。如果仅仅是切除了一侧的卵巢和输卵管的话，对侧仍然有卵巢，输卵管仍然可以正常怀孕的，只不过怀孕的几率会稍微的降低。对于卵巢巧克力囊肿有可能不需要切除输卵管和卵巢，仅仅去把囊液吸出，囊皮切掉病灶切除，则不会影响女性的生育。女性仍然在手术后可以正常的生育的，建议夫妻双方如果有备孕计划的话，可以在排卵期前后进行性生活。

巧克力囊肿穿刺抽液术是指在超声引导下经皮穿刺抽吸巧克力囊肿内积血联合硬化剂硬化治疗。是在超声影像的引导和监视下，利用直径一点一毫米的金属针准确穿刺到“巧囊”内，穿刺路径可以是经下腹部或者经阴道，主要视患者已婚否和囊肿的位置高低以及穿刺路径上的障碍大小等因素而定，先把长期淤积的陈旧性血液抽吸掉，用生理盐水充分清洗囊腔后，再用无水乙醇或聚桂醇冲洗囊腔，使得囊腔的内皮细胞发生坏死，丧失“再出血”的能力。硬化治疗是不将囊肿剥除拿出体外的，而是使得囊肿内膜坏死，坏死组织逐渐被机体吸收达到治疗目的。穿刺硬化治疗的最大优势是真正的微创，在腹壁、囊肿壁上仅仅造成一点一毫米的细微穿刺针眼，对聚桂醇硬化剂对卵巢组织的损伤十分轻微。不过，巧克力囊肿首次治疗一般选择手术治疗。复发的患者可以选用穿刺抽液的方法。

巧克力囊肿手术治疗是首选。药物治疗主要达到卵巢抑制目的，或“假孕”和“假绝经”。目前常用药物是孕激素、内美通和促性腺激素释放激素激动剂等。促性腺激素释放激素激动剂作用机制是通过下调垂体促性腺激素分泌，抑制卵巢释放雌、孕激素，造成体内低雌激素状态，起到暂时性药物“去势”作用，使异位内膜萎缩达到治疗目的。研究证明促性腺激素释放激素激动剂有效且安全，主要副反应是低雌激素状态引起更年期症状，如潮热、出汗、阴道干涩、烦躁、抑郁及骨质丟失、关节痛等。为改善用药者症状，需同时补充少量雌激素，即“反向添加”治疗，目的改善低雌激素状态的同时，不促进内异症病灶复发。“反向添加”除可明显改善症状外，骨密度下降也会减少。对内异症引起疼痛治疗办法最多，但特效药不多，治疗效果不理想。可首选非甾体类消炎药，如布洛芬等。若没有生育要求，可放置曼月乐治疗。

巧克力囊肿可能是子宫内膜异位、浆液性囊腺瘤或者黏性囊腺瘤造成的。巧克力囊肿是一个卵巢上的囊肿，囊内液是那种巧克力的颜色，所以叫巧克力囊肿，关于巧克力囊肿的形成机制很复杂，到目前为止还没有发现确切的病因。卵巢的子宫内膜子宫内膜异位到了卵巢上，每个月子宫内膜出血卵巢它也出血，日积月累就形成了咖啡色的囊肿。目前在全球妇产科的工作者都在致力于去研究到底是什么原因造成，从而能突破这个攻克难关。如果囊内伴随着出血，也会因为血液而污染了囊内的液体。也会变成咖啡色，也会变成巧克力色。需要取下来做病理检查才能知道，到底是什么原因造成。