巧克力囊肿是一个卵巢上的囊肿，它的囊内液是巧克力的颜色，所以叫巧克力囊肿，关于巧克力囊肿的形成机制很复杂，到目前为止还没有发现它的确切的病因。但是最常见的是卵巢的子宫内膜异位囊肿，就是说子宫内膜异位到了卵巢上，每个月子宫内膜出血卵巢它也出血，日积月累就形成了囊肿。至于子宫内膜异位到卵巢上的原因，这是一个目前来讲还没有得到确切答案的难题。除了卵巢的子宫内膜异位囊肿以外，还有一些囊肿比如浆液性囊腺瘤或者黏性囊腺瘤，如果囊内伴随着出血，也会因为血液而污染了囊内的液体变成巧克力色。那么在这个时候需要把囊肿取下来做病理检查，才能知道到底是什么原因造成的。