直肠囊肿手术方法还是需要先确诊一下囊肿的大小以及囊肿所在的位置，才能进行进一步的手术方案，最常见的还是经腹直肠癌切除，这样切除的比较干净，不会有残留，建议切除之后可以送一个病理，看一下是否有恶化的情况，如果有恶化的话需要配合化疗治疗一段时间。