突然闭经的病因是很复杂的，从控制月经周期正常的五个主要环节来看，下丘脑闭经最为常见，其次是垂体、卵巢、子宫及下生殖道异常闭经。例如长期或突然的精神压抑、紧张、情绪变化、厌食、癌症、卵巢早衰、多次人工流产、甲状腺、肾上腺、胰腺等内分泌功能紊乱都会导致突然闭经。