大多数输尿管结石来源于肾结石，由于重力和尿道蠕动减少而进入输尿管，所以输尿管结石与肾结石一样，以草酸盐结石为主，其次为尿酸结石。原发性输尿管结石少见，多继发于一些输尿管疾患，如输尿管息肉、肿瘤、囊、狭窄、憩室以及巨输尿管症等，由于输尿管中尿液淤滞，在尿液积聚扩张部位形成结石。