肛管直肠周围脓肿破裂或切口多在肛门外，脓液流出外口，但原发感染多在肛窦内，肛窦是继发感染的门户，反复感染，形成瘘管。肛门周围脓肿破裂后，脓液排出，脓腔逐渐缩小，外破裂切口缩小，腔壁形成硬管壁，结缔组织增生，不能自然封闭，大便、排尿、腹部压力增加或肛门括约肌的炎症刺激，自然导致肛瘘。