导致小儿发生慢性腹泻的原因主要是因为肠道菌群失衡，因为新生儿菌群尚未形成，如果在受到细菌、病菌和真菌等多种致病菌感染后，滥用抗生素的话，就容易引起慢性腹泻。另外，长期营养不良、乳糖不耐受和喂养不当的话，也容易造成小儿出现慢性腹泻的情况。

慢性腹泻的主要危害之一是会导致肠道菌群失调，可诱发真菌性肠炎、肠出血等多种大肠疾病，严重时可能会导致肠穿孔。同时会因为长期性腹泻而出现免疫力下降的情况，且会因此而发生继发性感染。除此之外，还会引起营养不良和肝肾功能异常。

导致慢性腹泻的原因之一就是消化系统疾病，比较常见的有肠道感染性疾病、肠道非感染性疾病，也包括肝胆胰腺类疾病。甲状腺功能亢进症、慢性肾上腺皮质功能减退等内分泌代谢性疾病也容易引发慢性腹泻，另外，慢性腹泻的发病和某些免疫性疾病也有关系。

慢性腹泻一般会导致大便次数明显增多，具有排便次数多且较急的特点，且大便状态也会变得异常，可呈现出大便溏稀、颜色较浅和粪便量少等诸多特征，往往会夹杂有少量粘液或脓血。另外，不少患者可出现发烧腹痛等全身性反应，还会并发营养不良和中毒性肝炎。

预防慢性腹泻的关键性措施之一为养成良好饮食习惯，不可以生食肉食，应避免进食刺激性较大的肥厚、油腻及生冷食物。同时要加强身体保暖，避免腹部受风受寒，平时则要积极参与体育锻炼，注意个人清洁卫生。除此之外，还要定期去医院做肠胃镜及大便常规一类检查。