每个口腔念珠菌感染的患者发病原因是不同的，婴儿可能是因为体内缺乏一种酶或者母亲的产道中含有念珠菌；部分患者可能是使用了抗生素这类的药物或者没有及时注意口腔卫生从而引起的义齿性念珠菌感染；还有部分患者由于全身疾病用药或者免疫力低下也会引起念珠菌感染。