为防止发生抗菌药相关性腹泻，医生应严格掌握抗菌药的使用指征，避免滥用抗菌药，尤其是广谱抗菌药，严格掌握疗程并及时停药。年老体弱患者，尤其是合并腹腔感染、营养不良和免疫功能低下者，尽量不使用易诱发腹泻的抗菌药。长期应用抗菌药的患者也应熟悉其药理作用及不良反应。用药期间还应密切观察有无毒副作用，如出现抗菌药相关性腹泻，应停用相关性抗菌药，使用黏膜保护剂、肠道微生态制剂、止泻药，并采用营养支持对症治疗。