颅咽管瘤全切除后5年复发率为10％～17％，而且颅咽管瘤的复发与肿瘤的切除程度有着密切的关系。至于肿瘤复发的时间，肿瘤复发大多数发生在5年以内，而以后明显降低。也有学者报道，经蝶手术入路颅咽管瘤切除术后复发率较低，这可能与采用该入路的颅咽管瘤主要局限于鞍内、与周围重要结构粘连较轻有关。