菌藻类主要指蘑菇、香菇、金针菇、木耳、银耳等真菌类食物以及海带、紫菜、裙带菜、龙须菜等海藻类食物。它们都属于比较“低等”的生物，有其独特的成分，对健康有重要作用，《中国居民膳食指南2007》建议注意增加菌藻类食物摄入。

菌藻类食物富含蛋白质、膳食纤维、碳水化合物、维生素和微量元素。干品香菇、蘑菇、发菜、木耳等蛋白质含量在15%~20%或更多。以至于，有些教科书错误地把它们讲成“高蛋白食品”。其实，菌藻类并不是高蛋白食品。因为我们很少直接吃干的香菇、蘑菇和木耳，通常食用的是鲜品或水发产品，水发后蛋白质含量多在1%~3%之间，与普通蔬菜相当。而且，一般每次吃木耳等大概也只有10克~20克(干重)而已，获得的蛋白质仅2、3克，亦与普通蔬菜相当。

与其他蔬菜不同，菌藻类含维生素C和β-胡萝卜素都很少，但B族维生素含量较普通蔬菜高。

海带、紫菜、裙带菜等海藻类含有大量的碘，每100g干海带含碘36mg(相当于一个成年人240天的碘推荐摄入量)。木耳等菌类碘的含量并不是很高。

除提供丰富的营养素外，菌藻类还具有明显的保健作用。研究发现，菌藻类含有的多糖物质，具有提高免疫功能、抗肿瘤、降血脂的作用。香菇多糖、黑木耳多糖、褐藻多糖(来自海带和裙带菜)都已经被先后开发成药品或保健品。

不过，也正是因为海藻类含有大量的碘，所以，有甲状腺疾病的人(包括甲亢、甲减、甲状腺结节、甲状腺瘤、甲状腺癌、甲状腺炎等)均应限制海带、紫菜、裙带菜等海藻类食物。

此外，菌类和藻类因为细胞结构简单，遗传物质相对发达，核酸(分子中包含嘌呤)含量较多，故而不适合高尿酸血症或痛风患者食用(此类人群宜低嘌呤饮食)。