肛周湿疹可以选用外用药膏，内服药物调配中药等方法治疗。对于慢性和假急性肛周湿疹引起的皮肤发红局部搔痒，可以使用免疫抑制剂或者钙磷酸酶抑制剂等药膏，治疗用药之后，能起到快速消除局部细菌炎症，来缓解。涂抹药膏之后，病情没有得到缓解时，需要在医生指导下口服抗组胺药物或者是糖皮质激素药膏进行治疗。
急性肛周湿疹可以到中医门诊进行中医辨证来判断病因，最好在医生的指导下调配健脾利湿的中药进行治疗。中药能够起到扶正固本，排除体内湿热及毒素等作用。出现肛周湿疹要及时进行检查，可以根据病因进行调配，来控制病情，治疗肛周湿疹期间，还要多吃清淡和高纤维食物，以起到润肠通便的作用。