摘除扁桃体对身体，多多少少有影响，但是影响不太大，不同年龄的病人摘除扁桃体，可能影响会有出入。
一般婴幼儿，扁桃体是机体一个非常重要的，免疫器官，对机体的免疫力的维持是有作用的，所以，婴幼儿除非必须，尽量不轻易摘除扁桃体。
有的人说阑尾有可能发炎，把阑尾摘就以后，不得阑尾炎，把扁桃体摘以后，不得扁桃体炎。婴幼儿尽量不要去做手术，除非扁桃体反复发炎，担心会引起来严重的并发症。因为扁桃体毕竟还是个免疫器官，摘以后，可能对婴幼儿的免疫力会有影响。
成年人扁桃体作为一个免疫器官的，作用已经非常弱，扁桃体里要么就是已经萎缩掉。如果成年人扁桃体比较大，里面更多的是纤维增生组织，而不是大量的淋巴组织，所以成年人的扁桃体摘除，对成年人的免疫力没有明显的影响。
当然成年人的扁桃体摘除，手术往往一方面是扁桃体反复发炎，担心会有全身的副作用，切完以后，这种风险就没有。成年人摘完扁桃体以后，可能咽炎会重，摘完扁桃体，嗓子会干，会有异物感，但这个其实大多数人是能够耐受的。