胆管良性狭窄顾名思义实际上是相对于肿瘤所致的狭窄而言。一般的原因，临床上常见对于儿童时，可能由于胆管发育的异常，造成局部的狭窄，后期如胆管里面出现有炎症，或者激发有结石或者胆管内有异物，或者胆管内有寄生虫，胆管的损伤，损伤以后的斑痕修复，都可能导致胆管流出道的变窄或者不通畅，相对于恶性肿瘤而言，这些疾病是良性的疾病，也就是说不会由于肿瘤导致最后的一个恶性结果，但是由于结石由于炎症或者异物等导致管腔狭窄，会由于胆道的引流不通畅而引起胆管的一个功能的异常，继发的引起肝脏功能的异常。
有些是胆管损伤以后的瘢痕修复，或者手术当中由于手术的误操作，导致缝针缝线撕破或者是引起了一个胆管的梗阻和狭窄，临床上表现为反复的胆管炎症，甚至受损这一侧的胆道完全的狭窄和梗阻，导致胆管所引流这一段的肝脏功能的缺失，所以这种情况下，是需要外科手术把病变这一侧的胆管进行切除，或者是讲把狭窄的这一段的胆管进行切除，然后重新建立胆肠吻合或者是胆管的对端吻合或者修复的手术，重新建立胆道的引流通道，此外还有一种由于自身免疫相关的疾病导致硬化性胆管炎，这个也会出现胆管狭窄的情况，这个是需要内科治疗，进行激素或者免疫条件治疗，在临床上也不少见。