胃蛋白酶原比值指的是抽血化验的胃蛋白酶原1与胃蛋白酶原2的一个比值，这个值一般是在7.5左右。如果是低于7.5，就比方说3.0~7.5之间，可能消化能力会下降，胃酸这些分泌会有一点受限。但如果是低于3.0，就可能存在一些萎缩性胃炎，肠上皮化生等病变了。
胃蛋白酶原它分为1和2，胃蛋白酶原它分泌到胃内以后，它会被已经产生的胃酸或者胃蛋白酶等作用活化，变成胃蛋白酶，对的蛋白的消化吸收有很重要的意义。胃蛋白酶原1它主要是胃底腺分泌的，这个地方的那些主细胞来分泌的。如果是胃蛋白酶原2，它除了胃底腺的部位能够有分泌，它还有很多是在胃窦这些地方来分泌，就是幽门腺这些来分泌。如果是存在有胃部的一些炎症，萎缩等情况，胃蛋白酶原的比值就会出现问题。
首先是胃蛋白酶原它会下降，而且这个比值出现异常。所以在临床上，认为抽血化验胃蛋白酶原就相当于一个实验室的一个活检，就不需要取胃里头的病理组织去化验，也能够大致知道它的萎缩的情况，现在已经比较广泛的应用于消化的临床的一个检测。
胃蛋白酶原之前是医保不报销的，目前应该是大部分地方都是可以走报销了。胃蛋白酶原也有很多是应用于科研，比方说来研究药物或者说食物等成分，包括幽门螺旋杆菌等等对于胃的一些损害的原理，就可以来观察胃蛋白酶原水平的情况。