头顶右侧一阵一阵刺痛原因比较多，首先要考虑可能是偏头痛。偏头痛指的是头部的一侧，或者双侧的中、重度的搏动样的疼痛，疼痛性质是比较剧烈的，会影响到患者的日常工作与生活。持续时间4-72个小时，患者喜欢在安静的、昏暗的小房间内休息，一般症状也会逐渐缓解。但是会反复发作，是偏头痛的现象。
还有一种疼痛也叫做紧张型头痛，又称为神经性疼痛。特点就是头部不定部位的，可能是一侧也可能是全头部的针扎样的疼痛，或者是钝痛、隐隐作痛的疼痛，一般与患者比如情绪过度的激动，或者是心情比较焦虑、比较紧张、睡眠不佳等都会引发疼痛，但一般不影响患者日常工作与生活，不影响到睡眠。但是持续时间会非常久，患者会伴有焦虑、行为怪异、暴躁等情绪的改变。
当然还有一些疼痛，比如像枕神经痛、耳大神经痛、三叉神经痛等都会引起刺痛。当然如果头皮的带状疱疹，也会引起一阵一阵的刺痛，就需要仔细的去查找病因了。一般原因比较多所以还建议患者，及时就诊于神经内科，进行头颅CT检查、头颅核磁共振平扫，加上血管的扫描等，包括经颅多普勒的检查等，目的是查找病因。如果一旦确诊有脑血管的问题，比如像血管的畸形、颅内肿瘤等，需要及时进行手术治疗。
如果除外了脑部血管的器质性疾病，就按照功能性疾病进行处理。比如口服对乙酰氨基酚，口服阿司匹林，以及包括布洛芬等解热镇痛药物来缓解症状。必要时可以服用像麦角胺咖啡因，或者是盐酸曲普坦、舒马曲普坦等缓解症状。如果是神经的疼痛，比如带状疱疹引起的神经痛，或者枕神经痛、耳大神经痛，可以服用卡马西平，或者是加巴喷丁、腺苷钴胺、维生素B1等营养神经镇痛药物来缓解症状。