慢性腹泻可以对症服用中成制剂治疗，若是与湿热下注病症有关，可以服用葛根岑连丸。脾肾阳虚者可以选择服用四神丸，在存在有脾肾虚寒一类病灶时则可以改用泻痢固肠丸。除此之外，还可以服用参苓白术丸、调脾止泻丸以及枳实导滞丸一类中成制剂。文中药物仅供参考，需遵医嘱谨慎用药。

导致慢性腹泻的原因之一就是消化系统疾病，比较常见的有肠道感染性疾病、肠道非感染性疾病，也包括肝胆胰腺类疾病。甲状腺功能亢进症、慢性肾上腺皮质功能减退等内分泌代谢性疾病也容易引发慢性腹泻，另外，慢性腹泻的发病和某些免疫性疾病也有关系。

慢性腹泻会引发的并发症之一就是感染，除了一般的感染之外，还包括真菌感染，甚至是全身性的真菌病。再就是会出现营养不良以及维生素缺乏症，这也是慢性腹泻常见的并发症之一。除此以外，慢性腹泻的并发症还包括病毒性心肌炎以及中毒性肝炎。

如果慢性腹泻的病情比较严重，大便过于频繁，可以适当的应用止血药物进行治疗，常用的就是蒙脱石散。再就是可以使用微生物制剂来调理肠胃，改善肠道微生态环境。如果存在细菌感染的情况，可根据具体的致病菌选择合适的抗生素类药物，若腹痛严重，则需要应用解痉止痛的药物。

慢性腹泻在中医上被分为多个证型，其中分为寒湿泄泻型、水饮留肠型、湿热泄泻型和瘀阻肠络型等等，建议可以服用平胃散、苓桂术甘汤合己椒苈黄丸加减、葛根芩连汤加减和少腹逐瘀汤加减等药方。这些药方对治疗慢性腹泻都有一定的效果，除此之外，还可以针灸天枢穴、足三里穴等部位，这样能够改善症状。