结膜囊肿一旦出现，无法自行消退，如果不治疗，囊肿常会逐渐的长大。不过囊肿较小，没有明显不适症状时，可暂时不治疗；囊肿较大，影响到视力时，可以通过热敷、应用抗生素、手术切除等方法治疗，其中手术切除是治疗结膜囊肿最有效的方法。