小儿慢性腹泻的病程一般会持续两个月左右，还有的患儿可能不会持续性的腹泻，但每次发作间隔时间都在两到四周不等。患儿每次病情发作时，都会表现为大便次数增加、大便性状稀薄，且伴随有腹痛、肚脐胀痛的症状。而导致慢性腹泻病程延长的原因，主要是原发病未能及时控制有关。

慢性腹泻的主要危害之一是会导致肠道菌群失调，可诱发真菌性肠炎、肠出血等多种大肠疾病，严重时可能会导致肠穿孔。同时会因为长期性腹泻而出现免疫力下降的情况，且会因此而发生继发性感染。除此之外，还会引起营养不良和肝肾功能异常。

临床上确诊慢性腹泻可以根据所出现的各种不良表现，如果发现有持续性腹泻及腹痛发烧等症状，就需要高度怀疑该病发生。同时需要借助于粪便常规检查和粪便细菌学培养检查来确定病情，且要接受消化道内镜和呼气试验方面的检查，必要时可做超声波和影像学检查项目。

慢性腹泻在中医上被分为多个证型，其中分为寒湿泄泻型、水饮留肠型、湿热泄泻型和瘀阻肠络型等等，建议可以服用平胃散、苓桂术甘汤合己椒苈黄丸加减、葛根芩连汤加减和少腹逐瘀汤加减等药方。这些药方对治疗慢性腹泻都有一定的效果，除此之外，还可以针灸天枢穴、足三里穴等部位，这样能够改善症状。

慢性腹泻的发病和某些全身性的疾病有着密切的关系，比较常见的就是糖尿病，部分患者是因为甲状腺功能亢进所致。某些胃肠道疾病也容易引起慢性腹泻，比如说溃疡性结肠炎，再就是患有大肠癌，还有部分患者是因为患有克隆病，也就是节段性肠炎。