隐睾手术的方法有传统的手术切开治疗和腹腔镜下辅助手术治疗。传统的手术方法的后遗症就是手术区域的皮肤、肌肉、神经产生损坏后所造成的相应的并发症，比如皮肤的瘢痕、疼痛，肌肉打开再缝合之后，造成肌肉的挛缩、结节、运动时疼痛等等。如果损伤到髂腹部神经，还会造成手术区域和手术区域以下的部位的疼痛、麻木等等症状，腹腔镜手术需要在腹膜后对精索进行游离松解，使睾丸能够有足够的长度来进行下降，相应的后遗症和并发症就是腹腔镜所造成的腹腔内的脏器损害，以及疝气的发生等等。