怀孕了扁桃体发炎也是可以吃药的，但是一定要注意要在医生的指导下用药，服用一些对胎儿和大人都没有影响的药物，比如说可以服用达力新片和维生素c胶囊治疗，这种药物对小孩子没有多大影响，也要注意多喝一些温开水，饮食尽量以清淡为主。如果长期如此的话，最好还需要检查一下是否严重。