慢性腹泻的病程一般是两个月以上，如果连续两个月都出现了腹泻的症状，可以被称为是慢性腹泻；除此之外，如果腹泻发作的时间不长，但是在一年内累计发作超过了三个月，也可以被称为慢性腹泻。如果在这期间出现的食物中毒、消化不良或肠道疾病，就可能会使慢性腹泻的病程延长。

导致慢性腹泻的原因之一就是消化系统疾病，比较常见的有肠道感染性疾病、肠道非感染性疾病，也包括肝胆胰腺类疾病。甲状腺功能亢进症、慢性肾上腺皮质功能减退等内分泌代谢性疾病也容易引发慢性腹泻，另外，慢性腹泻的发病和某些免疫性疾病也有关系。

慢性腹泻的常见并发症为营养不良和维生素缺乏症，与长期性大便次数增多和营养流失有关。同时会导致抵抗力下降，而出现真菌性肠炎一类继发性感染疾病。部分患者可能会并发中毒性肝炎，还可有电解质紊乱及肠出血的可能性，严重时会导致肾衰竭。

慢性腹泻和急性腹泻的发病原因、症状表现、发病时长，以及治疗方法都有所不同。慢性腹泻的病因比较复杂，可能是因为疾病或受到了感染所造成的，如果不及时治疗，可能会出现营养不良的情况，且发病时间较长，在治疗上需要根据病因针对性处理。急性腹泻主要是因为吃了不干净食物所造成的，发病时间比较短，患者容易出现发热的症状，需要使用一些调节水电解质的药物。

婴儿慢性腹泻的症状主要表现为精神萎靡、排便次数增多、大便不成形、腹部疼痛等等，一旦出现了这些情况，就需要引起重视，避免病情加重。如果是因为细菌或病毒感染所引起的慢性腹泻，就可能会出现体温升高的症状，极少部分患者会出现低热的情况。