治疗病毒性脑炎是综合治疗的，病情较轻的患者可在7天内出院，口服抗病毒巩固治疗。如果病情严重，需要伴随着康复治疗的，疗程一般为2-3周，对于继发于病毒感染的自身免疫性脑炎患者，如果对一线药物敏感，疗程约2-3周，如果对一线药物或二线药物不敏感，治疗时间较长。