其中大部分是小核糖核酸病毒，如柯萨奇病毒A、B、腮腺炎病毒、罕见肝炎病毒、脊髓灰质炎病毒等。此外，单纯疱疹病毒Ⅰ型、Ⅱ型、腺病毒、水痘带状疱疹病毒不仅能引起脑实质炎症，而且只累及脑膜。由肠道病毒引起的病毒性脑膜炎主要发生在夏秋和初秋。