如果做肠镜不小心让肠道穿孔，一般当天就能发现，因为做完肠镜之后穿孔会引起剧烈腹痛，而且还有可能会导致大便出血，甚至会影响到正常的食欲，所以如果发现这种情况下尽快去医院检查，可以再做一次肠镜，发现穿孔也要及时处理，避免肠穿破烂。但是目前做肠镜检查还是比较安全的，大多患者做完检查之后都不会有什么异常，而且也不会发生穿孔现象，这种情况不排除是因为有不适应感，或者是在做肠镜检查吃药后所引起的不良反应。