面肌痉挛的危害主要就是会出现无休止的面部抽动，甚至导致人极度痛苦，出现交流困难的情况，进而封闭自己，烦躁自卑，双侧面部大小不一即俗称的阴阳脸。早期多为眼轮匝肌间歇性抽搐，容易被误诊，较少出现双侧面肌，一定要注意早期症状识别。及早治疗，尽快控制病情，主要不要经常擦脸，避免过度按摩出现瘫痪的面肌，以减少后遗症的发生。

面肌痉挛手术后也可能会复发；如果面部血管再次压迫到面部神经，会导致面肌痉挛复发；脑组织异常放电，影响面部神经时，也会让面肌痉挛复发。不过复发率较低，不会超过5%。

面肌痉挛术后复发的原因之一就是垫片滑落，也有可能是面神经周围的其他血管发生变化，使得神经再次被压迫。除此以外，术后粘连或手术效果不佳也会导致面肌痉挛术后复发。

面肌痉挛手术后头疼可能是因为释放了脑脊液引起颅内压降低所致，也有可能是手术时残留的淤血刺激脑血管和硬膜，另外就是术后出血或者血肿。

面肌痉挛手术出现后遗症的几率不大，但手术不当，损伤到相邻神经、器官时，可能会引起听力减弱或丧失、面瘫、脑脊液耳漏、复视、咽困难等后遗症。