双侧筛窦炎的患者，治疗的关键是在足够的疗程内使用抗生素，可以选择青霉素类或是头孢菌素类抗生素。如果患者伴有头痛或局部剧烈的疼痛感，也可以适当配合口服一些消炎药和镇痛的药物。部分双侧筛窦炎的患者也会伴有发烧的去，在体温超过38.5时，还需要使用退烧药物来进行治疗。在药物治疗的同时，患者还可以通过鼻喷雾剂等改善鼻腔的通气情况，或是使用生理盐水冲洗鼻腔。