由支原体和衣原体引起的相关疾病，要按照感染的情况断定好治与否，多数情况下不是治疗，而是难以预测诊断。支原体和衣原体引起明显肺炎时，需要咳痰，止咳或并用平喘药。支原体和衣原体的感染可以引起各种各样的种类，如果明确的话，也可以投用抗生素进行治疗，就像大环内酯类的药物。如果该病原体对其中一种使用的抗生素具有耐受性，在明确的情况下，也可以更换为其他抗生素进行治疗。