新生儿肺动脉高压，根据病因不同，效果不一样。如果原发疾病是肺血管失调，如缺氧所致肺动脉血管暂时性高血压，经缺氧纠正后，痉挛性肺血管可能会慢慢松弛，甚至慢慢改善，相对容易治疗，大多数可以治愈。如果其他原因导致新生儿肺动脉高压，如罕见的平滑肌增生或肺血管发育异常，复杂的先天性心脏病引起的反流障碍，此时的肺动脉高压治疗难度更大，更难治愈。