慢性腹泻的主要危害之一是会导致肠道菌群失调，可诱发真菌性肠炎、肠出血等多种大肠疾病，严重时可能会导致肠穿孔。同时会因为长期性腹泻而出现免疫力下降的情况，且会因此而发生继发性感染。除此之外，还会引起营养不良和肝肾功能异常。

慢性腹泻的常见并发症为营养不良和维生素缺乏症，与长期性大便次数增多和营养流失有关。同时会导致抵抗力下降，而出现真菌性肠炎一类继发性感染疾病。部分患者可能会并发中毒性肝炎，还可有电解质紊乱及肠出血的可能性，严重时会导致肾衰竭。

慢性腹泻和急性腹泻的发病原因、症状表现、发病时长，以及治疗方法都有所不同。慢性腹泻的病因比较复杂，可能是因为疾病或受到了感染所造成的，如果不及时治疗，可能会出现营养不良的情况，且发病时间较长，在治疗上需要根据病因针对性处理。急性腹泻主要是因为吃了不干净食物所造成的，发病时间比较短，患者容易出现发热的症状，需要使用一些调节水电解质的药物。

小儿腹泻很容易出现迁延性和慢性腹泻，主要是小孩出现腹泻后，治疗方法不得当，导致病情延长，或者滥用抗生素导致肠道菌群失调引起的；另外小儿重度营养不良、免疫力差、对牛奶蛋白过敏、出现乳糜泻时，也会伴随着迁延性和慢性腹泻出现。

现在很多的病症，都讲究食疗，就是患者日常的饮食按照一定的要求进行，就能保证病情的尽快恢复。这种慢性结肠炎的患者在日常可以经常吃蜂蜜制品，来养胃。然后吃饭不能过量，要准时吃饭，然后改掉自己的不良饮食习惯，就能更好的帮助病情康复。