肛周脓肿会导致患者肛门出现疼痛，痛感会异常强烈，并且会慢慢加重。引发患者吃不下饭，睡不着觉，影响到患者的正常生活。在脓肿破裂之后，疼痛能暂时消失。其另外的严重症状是持续发热，热度最高能达到40°及以上，脓腔的面积越大，扎根越深出现发热的可能会更大，引发患者便秘，精神状况差等。