子宫内膜只有5毫米，但是已经怀孕了，这是属于正常的。但在怀孕期间要密切观察身体情况，因为子宫内膜5毫米还是属于有点偏离正常，当身体出现不舒服及时的到医院进行检查，以免会出现子宫出血，导致突然流产。其次要多注意休息，不要做过于剧烈的运动，会使内膜得到修复。