胃肠道肿瘤淋巴瘤少于4500例，其并发症也不是很高。对于五周内超过5000次的放射治疗，并发症的风险约为8%。主要不良反应为放射性肠炎、腹腔、盆腔放射治疗引起的放射性肠炎。放射性肠炎的主要表现是腹痛和腹泻。如果增加了放射治疗并且病人仍然患有该症状，并且对于其他治疗方法必须终止放射治疗和化学治疗。