急性鼻窦炎主要由上呼吸道感染引起，细菌和病毒感染可以同时发生。常见的菌群是各种化脓性球菌，如肺炎链球菌、溶血性链球菌和葡萄球菌，其次是流感嗜血杆菌和卡他莫拉菌，这在儿童中很常见。其他致病菌包括链球菌、厌氧菌和金黄色葡萄球菌。大多数由牙科疾病引起的病人是厌氧菌，脓液通常气味难闻。真菌和过敏也可能是致病因素。