切除腋下汗腺如果操作不当可能会导致皮肤损伤、短期复发的情况，所以一般难度较大。
在切除腋下汗腺时如果切除过多，可能会对皮下血管网的损伤过大，造成皮肤血供破坏殆尽，使皮肤坏死的概率增加，可能会导致皮肤坏死、大片脱落。但是在切除腋下汗腺时如果切除不够，皮肤一般可以顺利愈合，但是会短期容易复发，手术的效果难以保证。