益生菌对保存环境要求是非常高的，如果保存不当会影响到药效的，一般微生态制剂的活菌数及存活时间与储存条件密切相关，活菌一般都有怕光、怕热、怕湿等特点，温度越高、湿度越大，活菌存活时间越短，不正确的储存条件可能会严重影响疗效，有些制剂如培菲康、金双歧和常乐康等标明了冷处保存，也有的制剂没有特殊要求，有效期可达24个月，给销售和患者均带来了很大方便，有利于提高患者依从性和治疗效果。