性交射精时出现疼痛可能是平时纵欲过度、过于劳累所致等生理因素引起的，也可能是炎症感染、结石疾病、肿瘤疾病、其它疾病等病理性疾病引起的。

一、生理因素

1.纵欲过度：如果在平时纵欲过度，性生活次数过多，或者频繁手淫，就可能会导致阴囊或会阴部内有酸痛不适感，进而也就会在射精时疼痛发作。

2.过于劳累：若长期从事较重体力活，或参加比较剧烈的体育活动，而没有在充足休息的情况下发生性生活，就也容易伴随有射精疼痛的反应。

二、病理性因素

1.炎症感染：导致射精疼痛的主要疾病就是生殖器官炎症。如果患有附睾炎、精囊炎或者精阜炎等炎症性疾病，射精时阴茎部位肌肉会发生节律性收缩，从而引起性交射精疼痛等不适感，严重时还会导致疼痛性遗精。同时也有可能是前列腺炎所致，与尿道炎症也有关系。

2.结石疾病：尿结石发病率较高，若小的结石卡在后尿道，特别是射精管的开口部位，就会导致局部软组织收缩蠕动，挤压到结石时便可出现疼痛感。另外，还有可能是膀胱结石或输尿管结石所致。

3.肿瘤疾病：生殖系统肿瘤可引发明显的射精疼痛感，性能力可能会直线下降。这时要着重检查附睾、前列腺和精囊等多个部位是否长出了肿瘤，并要及时做病理学检查确定肿瘤的良恶性。

4.其它疾病：除了上述疾病之外，若存在有尿道狭窄和阴茎硬结症、精索静脉曲张，以及严重的包皮过长等疾病，也可成为性交射精时疼痛的诱发因素，故要尽快到医院接受检查和诊断。